小新今年5岁了，不要以为他是那种懵懂无知的小孩，他其实人小鬼大，喜欢漂亮的姐姐，收养了一条棉花糖一样的流浪狗——小白，还经常讲些无厘头的黄色笑话。小新的妈妈美伢是一个全职主妇，粗心而又有点神经质的她经常被小新捉弄得七窍生烟，爸爸野原亦经常被这两母子搞得晕头转向。《蜡笔小新》的作者以一个5岁小童的眼光，40岁的成年人的心态去观察这个大千世界，看到了许多光怪陆离的景象，小新一家的幽默故事亦由此产生。
他转生成被称作拥有智慧的武器·剑，一边梦想着可以与装备者相遇，一边孤独地收集技能。有一天，他不小心踏进了会吸收魔力的枯竭森林，无法动弹之时，他遇到了作为奴隶遭受欺凌的黑猫族少女。芙兰正遭遇巨大魔兽的袭击，陷入了走投无路的境地。她拔出插在自己面前的他，并利用其力量摆脱困境，给他取名为师父，成为了正式的装备者。成为冒险者的芙兰和师父，为了磨练彼此的技能开始完成各项任务。芙兰为了达到顶点进化，师父则为了实现少女的愿望。猫耳少女和宠女剑的大冒险即将开始——
在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……。
I 末裔の章 II 鍵の章 III 帰還の章
故事的開始是被認為是宇宙中心的星球，銀河鐵道的全部乾線的起點站迪斯迪尼(Destiny)。有紀學為了繼承不在世的父親和哥哥的遺志，加入守護銀河鐵 道的安全的空間鐵道警備隊(簡稱SDF)。SDF為了守護在宇宙被認為是正確的銀河鐵道的運行日程，應付在各線路發生的事故，如災害、救命急救、宇宙海盜 的討伐等。 與SDF與銀河鐵道全線拉上關系的是一神謎的美女Layla Destiny Shura，她持有看出人和生物，行星的命運的能力。她並不會隨時使用其力 量，讓旅客自己尋找自己的方向，可說是一個「命運的守護者」。可是，有人用邪惡的力量打算改變旅客的命運，迫使她發動出隱藏的力量。
期望不受束缚自由自在生活的遥，与最好的伙伴们迎来高中最后的夏天。因为看不到毕业后的将来而感到迷茫，无法集中精神，继而与担心他的真琴等人争吵起来。和这群无可取代的同伴们有着深厚牵绊的遥，想去的未来究竟在哪里呢？
