神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
仙乐国太子谢怜接连被贬后第三次飞升成仙，却不慎破坏了神官们的金殿，无人供奉的他只能下凡除鬼来换取功德作为补偿。在凡间的历练中，谢怜结识了两位来帮助他的小神官，并认识了诡王花城，四人一同解决了一件件诡谲的事件，并逐渐接触到了看似光鲜亮丽的仙界众神官的黯然往事。
祁小智意外来到精灵世界，结识了精灵世界的好伙伴，有精灵猎人苏瑾、陆大班，活泼可爱精灵搭档火暴暴、金刚虎、水玄武，他们在冒险中不断学习和历练。但是，邪恶的力量不期而遇，正在破坏精灵世界的美好家园。他们团结一心，利用勇气、智慧和友情等精神力量，一起抵抗恶势力，守护精灵世界的安全与和平。
少年杨凡妹妹惨死，并惨遭女友出卖，机缘巧合之下重生回到了末世爆发前！ 上一世，你们欺我、辱我、出卖我，这一世重生归来！ 杨凡捏了捏手中的超级戒指：“只有最强者才配生存下去，而我，就是那个最强者！”
大头儿子和小头爸爸在体验“祖传反派”王博士发明的新产品“迷你乐园”时，被意外弹出，以迷你状态回归现实世界！父子俩在野外“遭遇”一群神奇“伙伴”，惊险、躲藏、追逐、救援……好伙伴不打不相识，闪电司令部就此集结，为对抗共同敌人开启了一场惊险刺激的大冒险！他们会遇到怎样的危机？这背后又隐藏着怎样的大阴谋？他们能否成功战胜邪恶？这场奇幻冒险之旅，又是否会改变大头儿子和小头爸爸的关系？
