神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
五十年前，江湖突然被 “混沌”入侵，慕容穹组建魔教对抗，艰难苦战不得胜利。神使易枝花降临，教会众人妖化功法成功战胜混沌。可神使离开，妖化功法传入江湖后失控，慕容穹失望退隐。他的手下余化冰趁机上位，改良妖化功法，竟创造出朋克真气时代，让江湖欣欣向荣，但代价就是江湖客们都变成了“上功怪“”。有着赤子心的少年东方胜，找到了归隐在向西饭店的慕容穹，想靠他恢复昔日江湖荣光，啼笑皆非的故事自此拉开帷幕……
天才少年萧炎曾是万众瞩目的家族希望，却因斗气尽失无法修炼陷入人生低谷。自幼与萧炎定下婚约的纳兰嫣然被加玛帝国超级宗门云岚宗收为弟子，纳兰嫣然不满萧炎现状来到萧家强行退婚，萧炎为维护家族荣耀与她定下三年之约。萧炎拜师药老重拾信心，为尽快提升实力决定外出历练。萧炎告别父亲萧战与青梅竹马萧薰儿，踏上了一段惊险刺激的修行之旅。因自身功法特殊需要吞噬异火进阶，萧炎来到危机重重的塔戈尔沙漠探寻异火线索。
斯靳恒与黎浅洛的婚礼即将举行，就在这时新娘休息室枪声响起……二人的婚礼是否还能继...
故事发生在以武为尊的九霄大陆，讲述了现代学生林枫，因为一场车祸，穿越到武魂未觉醒的“废物”林家大少爷身上。从此以双武魂之力，一路突破修为，披荆斩棘，收获知己红颜
萧炎（刘三木 配音）曾是家族里公认的斗气天才，年仅11岁便已经抵达了常人穷尽一生都无法修炼到的境界。可12岁那年，一场意外让萧炎的全部努力都化为了乌有，失去一切的他体会到了人情的冷暖和世态的炎凉，之后，萧炎和纳兰嫣然（鬼月 配音）许下了决斗的三年之约，来到魔兽山脉，在身世神秘的药老（黑石稔 配音）手下修炼。 三年间，萧炎的身影穿梭在塔戈尔大沙漠和加玛帝国黑岩城等地，结识了云芝、小医仙（醋醋 配音）等志同道合的好友，并且最终获得了强大的力量。三年一晃眼就过去了，萧炎毫无悬念的战胜了纳兰嫣然，却没想到，他的故事和劫难才刚刚开始。
九重天危机后，世界又恢复了一派安宁景象。当今社会，手机、电脑等电子设备成为了人们的生活必需品，网络信号覆盖全球。有很多人沉迷其中，忽略现实生活，导致生理、心理疾病，甚至道德败坏。这成为了现代社会的顽疾，也让地球成为了黑暗势力的新目标。病毒机械兽来袭地球，散播黑晶，黑晶像蒲公英一样飘入人们的电子设备屏幕里，吸收能量后吞噬屏幕面前的人，使普通人变成黑士兵，而一些沉迷网络，或有网络恶习的人变成机械兽。
