在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
叽歪老表是一对永不消停的“虫兄虫弟”。表哥大叽是来自北方“南漂”的瓢虫，天性憨直傻楞，但却好运爆棚，遇事总能逢凶化吉。表弟小歪是在南方本地生活的潮虫，满脑子都是精明算计的歪脑筋鬼主意，但却总是搬起石头砸自己的脚。两兄弟混迹在游乐园旁的草地，遭遇了形形色色的人和事，开始了他们不停作妖捣蛋的爆笑日常。
修士吕少卿因为意外获得仙宝“春秋戒”，被正道仙盟列为灭世魔头追杀至死，意外穿越时空回到了千年之前，并且和杀害自己的敌人共用一副肉身，深处敌巢的吕少卿为了活命，对内身斗智斗勇抢夺身躯，对外料敌先机广纳异宝，最终在其斗智斗勇之下，吕少卿成为人见人嫌的正道第一浪荡子！修真世界的隐秘也逐渐浮出水面，吕少卿掐指一算，这历史，早已改变！
水神共工为了争夺人间的主导权，与水神祝融发动了一场大战。共工撞倒了托举苍天的不周山，导致天河倾泻，洪水泛滥。共工企图用洪水控制人类。 鲧受命治水，为堵住洪水，鲧偷盗天物息壤，被天雷劈死。死后尸体化成一座大山，大山孕育了禹。禹出生后，结识了庚辰、伯益，和修行五百年的耳鼠，并救下受伤的应龙。舜将禹等带回都城，培养成才。正值洪灾加剧，舜不得已派禹等人治水。共工得知此事，率领一群妖神一路阻难。 禹经过涂山，邂逅女娇，坠入了爱河，却发现女娇中了共工手下无支祈的魔咒，即将变成石头。大禹毅然与女娇结婚。在变成石头前，女娇魔咒解除，还将开山斧交给禹。无支祈大怒，掳走禹的部下竖亥。禹救出竖亥，并将无支祈镇压在淮河。然后告别女娇，前往黄河治水。共工早已在黄河和去黄河的路上设下圈套。历经艰险与失败后，禹终于找到了治水方法——堵不如疏，破了共工的局，解决了黄河水患。正当禹要与女娇团聚时，又传来旱魃作乱、赤地千里的消息。禹打败旱魃，结果水火失衡，导致共工力量突增。共工召唤出九头蛇怪相柳进攻都城，又放出无支祈水淹涂山。是拯救天下百姓，还是去救女娇，两难之中的禹最后选择了前者，消灭了相柳。而女娇在无尽的等待中心死，变成石头。此时相柳尸体又化成毒液，即将流毒天下，禹不得不重走父亲老路，偷盗息壤，堵住了毒水。天将问罪，鲧为禹挡住天雷，粉身碎骨。禹终于回到女娇身边，悲痛万分。众人齐心协力，与共工决战，终于将其打败，天下再无水患。而禹则决定永远陪伴女娇石像，舜屡次征召要让出帝位，禹不为所动。终于某一天，女娇复生，还生下启。禹这时才接受舜的禅让，并请求天帝释放共工，令其戴罪立功，守护百姓。一个太平时代开启了。
玩具们敢怒不敢言，只有正直的“溜冰鞋”站出来坚决反抗，却被驱逐出去，无家可归。富有同情心的布娃娃不顾大牙狗的威胁与T恤猫的利诱，甘愿放弃大好前程，只身去找“溜冰鞋”。二人被好心的垃圾筒收留，总算有了安身之地。 一天，“溜冰鞋”在灯桂上发现了一只不知何处断线飘来的风筝，上面还有一只顽皮可爱的伴伴龙。“溜冰鞋”、布娃娃和垃圾筒在一起商量决定：将风筝与伴伴龙送还给原来的主人。 不料，此事被大牙狗与T恤猫发现，并从一本古书中得知了风筝的秘密——谁拥有它和伴伴龙便可以做神龙王国的皇帝。于是，围绕着风筝和伴伴龙在神龙王国里展开了一个有趣、曲折的故事……
童话世界迎来了怪物和人类和平共处的新时代。但上一轮危机的始作俑者巴罗在进入黑暗大门后，被激活了身体内隐藏的神秘血脉。远古基因残存的记忆驱使巴罗去带领远古怪物们向人类复仇，巴罗彻底解开了在上一轮激战中，从黑暗大门的裂缝里逃逸出的三个怪物的封印，他们的能力苏醒，开始大肆破坏城市。猪猪侠震惊之余，得知自己的爸爸巴罗竟然是怪物的首领，决定找到爸爸，让他改邪归正。在已经走上歧途的父亲面前，猪猪侠没有选择助纣为虐，而是决定用亲情呼唤父亲的本心，终于让迫在眉睫的危机再一次消除。
