话说玉皇大帝安排唐僧师徒整理天庭档案后。搞得整个天庭鸡飞狗跳，玉帝被众神仙堵在了凌霄宝殿门口。众仙情绪激动，以不成功便成仁的誓死精神逼迫玉帝撤职查办师徒四人，还要登报道歉，摆酒赔钱。虽然玉帝也早就后悔死了，但毕竟人家是如来佛祖的关系户，而且天庭档案管理的工作又是自己安排的，现在开除他们好像也有点自抽耳光，思量再三，决定祸水要流外人田，让这几个狗血的家伙到自己的远房表哥宙斯和堂兄奥丁那里去。
在剧中，原来砍伐树木的光头强变身成为一名导游，在熊大、熊二的帮助下，去往森林深处找寻儿时玩伴东北虎，但不料森林里蜘蛛、毒蛇、反派与陷阱等危机四伏，让找寻变得困难重重，而新加入的女性角色鬼马精灵赵琳，又让这段冒险旅程更加刺激精彩。众人齐心协力，在艰难险阻中一路向前，给人以出乎意料的想像空间与观看感受。
女娲使用光明之土造出了率真善良，豪爽正义的龙娃。又用光明之水造出了英姿飒爽，温柔可爱的凤娃，龙娃和凤娃视女娲为他们的母亲。天空中出现了巨大的黑洞，整个人界即将面临灭顶之灾，女娲煮化了五色石，试图填补漏洞，却将龙娃和凤娃也封印在了天上，从此母子被迫分离。伤心的女娲日日思念自己的孩子们，流出的眼泪汇聚在大地之上成为了黄河。 一晃眼百年过去，人间遭到了邪恶势力的侵犯，而女娲亦被困在绝世界中，对一切都无能为力。就在这个节骨眼上，龙娃和凤娃在天界习得了一身好本领后踏上了寻找母亲的旅途，一路上，等待着他们的是强大而又邪恶的敌人们。
《乌龙院之活宝传奇》动画片第二季延续功夫喜剧的特点， 讲述师徒四人在寻宝救世的冒险旅途中领悟到信心和快乐才是真正的力量，展现了东方智慧和见义勇为的精神。故事主要讲述在神奇的“活宝”惊现江湖后，师徒四人在寻找到活宝的四个部分后，为了找到最后的活宝之首，乌龙院师徒登上了极乐岛。 在极乐岛上，众人遇见了失踪多年的艾飞父亲——艾迪生，在他的帮助下，从岛上的猴群手中找到了活宝之首。几经周折，众人在药王庄找到了奄奄一息的艾飞将其救活，右活宝也终于被拼接完整。失散千年的左右两个活宝在此重逢，师徒四人见任务圆满完成便启程返回乌龙院。 不料老沙客为提炼活宝原力，将左和右活宝都迷晕抓走。在提炼原力的中途却发生意外，80%活宝原力被其长子沙客季获得。沙客季妄图补全活宝原力，按照祖传秘法抓来极阳之人——乌龙院大师兄，不料活宝原力又意外的转移到了大师兄身上。 乌龙院大师父发现活宝之事并未平息，担心活宝强大的力量落入坏人之手，于是又展开了调查。通过线索众人一直找到庞贵人的密室，发现了沙客家族炼丹宗师沙客一的画像，并被带入一条密道。 原来密道是通往恒王地宫的，在地宫里众人遇到为了获得完整原力而来寻找麒麟胆的大师兄，可当麒麟胆现世时，却吸走了大师兄身上的活宝原力。原来所有一切都是死于千年前的沙客一设的局，他引来活宝原力是为了使自己复活，并妄图统治天下。 众人不敌复活的沙客一，沙客一利用活宝原力和炼丹术，控制着魔仆压榨百姓、炼造了大批如同真人的魔俑，天下江湖危在旦夕。为了阻止他的邪恶阴谋，众人齐聚铁堡，计划派出铁金刚二代和魔军抗衡。大战来临前，铁堡意外失火，铁金刚被烧坏，而此时却传来魔俑大军即将烧制完成的消息。重要关头，大师兄决定带队前往石头城，捣毁魔窑，双方大战将一触即发。
