天医会综合医院，统括诊断部。 这里汇聚了其他医生认为“难以诊断”的患者。 甚至连警方都束手无策的“杀人案件”与“谜团”也…… 天才医生天久鹰央将揭开这些离奇“疾病”背后隐藏的惊人真相！ “这个疾病（谜题），由我来下诊断——！！”

昭和58年初夏，在远离都市的山中小村雏见泽，从早到晚夏蝉们都在欢快地合唱它们的主题曲。圭一、礼奈、魅音、沙都子、梨花、诗音等社团成员明快的声音，也在雏见泽上空回荡。然而，梨花的脸上却浮现出悲哀的表情。因为每年6月举行的绵流祭又将临近，过去绵流之日的惨剧已经持续了4年。每年都会有一个人死亡，一个人下落不明，被称为“雏见泽连续怪死事件”。今年惨剧也将发生，但梨花她们仍试图切断惨剧循环的锁链……

吸血鬼及人造人、怪盗、狼人、开膛手，还有名侦探。异形蠢动的十九世纪末欧洲，人类亲和派的吸血鬼遭到银桩贯穿虐杀死亡。找来解决此案的，是专门处理人类避之唯恐不及的「怪物案件」的专门侦探轮堂鸦夜，以及带着奇怪鸟笼的男人真打津轻。他们从留存的线索和怪物才具备的特性导出推理。充满谜团宛如噩梦的笑剧，在此开幕！

3D立体視アニメーション化して『攻殻機動隊 S.A.C. SOLID STATE SOCIETY 3D』と改題された劇場版は、Production I.G初の自主配給作品である。タイトルロゴも攻殻機動隊 S.A.C.TVシリーズを踏襲するデザインに変更されており、オープニングは完全新作となっている。 観客が電脳化感覚を味わうことを目的に制作されており、電脳インターフェイス描画など飛び出す部分はOVA版（2006年）では見切れているため作り直されている。また、背景美術など当時の技術では実現できなかった色を出すためフルグレーディング処理が全カットに施されている。 東北地方太平洋沖地震の影響が残る中、メイン館新宿バルト9では公開初回から満席が続き、ミッドナイトショーを除き全回満席という高いシアターアベレージを得ており、2011年3月26日初日動員約2,500人、初日2日間の累計動員は4,580人、興収9,126,000円となり、全国9館の初日2日間の累計は動員11,768人、興収23,352,000円を記録した。 また、ぴあ初日満足度ランキング（ぴあ映画生活調べ）では満足度89.5で第1位と高い評価を得ており、20～30代を中心に3D作品やアニメの既存概念を打破する未知の3D映像という感想が多かった。 20日間で興行収入1億円を突破したため2011年5月7日からスクリーン数を3倍に拡大して公開することが発表された。

间指向了2030年，自从爆发第四次世界大战以来，各国的政治力量发生了根本性的变化，由于战乱不断，激增的难民终于获准进入日本，以填补因经济不断发展造成的劳动力短缺。而就在此时，一个自称“个别的十一人”的恐怖组织展开了一系列极端袭击事件，难民营、外国领事馆、甚至是总理都遭到了恐怖袭击……
难民抵抗运动的新领导人，同时也是“个别的十一人”的神秘前成员到底是谁？九课所掌握的众多线索也渐渐揭露了令人震惊的事实，在各种恐怖活动和突发事件的背后，有一人在阴影中操作着一切，他们策划的内幕是什么？九课能化解困境，并避免灾难性的内战吗？

2006年には「個別の11人事件」を描いたエピソードを約160分にまとめた『攻殻機動隊STAND ALONE COMPLEX Individual Eleven』が製作され、DVDでリリースされた。