攻壳机动队第二季

　　全52话
　　2009年4月5日 - 2010年3月28日

为了整理外婆的遗物，主人公鹰原羽依里在暑假独自来到了鸟白岛。                                    
                               　　走下一天只有几趟的渡轮，他遇见了一位少女。她任凭海风吹拂着发丝，只是眺望着……那水天相接的边境。回过神来，那位少女不知已经去往何方。羽依里似乎有些怅然若失，但他还是向外婆家走去。                                    
                               　　有一位羽依里的小姨住在外婆家，她已经开始在那里整理遗物了。羽依里帮忙整理着充满着外婆回忆的遗物时，也逐渐适应了初来乍到时让他无所适从的“岛上的生活”。                                    
                               　　在都市生活中无法体会到的，与大自然的邂逅。这样的岛上生活，能让他想起曾经遗忘的，值得怀念的点点滴滴。                                    
                               　　与眺望着大海的少女相遇。                                    
                               　　与迫寻奇幻蝴蝶的少女相遇。                                    
                               　　与寻找回亿和海盗船的少女相遇。                                    
                               　　与住在宁静灯塔的少女相遇。                                    
                               　　在岛上结识了新伙伴——曾经想着，如果这个暑假永远不会结束就好了。

　　故事发生在一年战争期间，正和初代高达的故事平行。到地球战线赴任的年轻联邦军官斯罗·亚玛达，在一次偶然的交火中，结识了敌人、也就是吉恩军的女驾驶员爱娜·萨哈林。这一对互相抱有好意的年轻人，因为正属于敌对的两方，所以不得不互相战斗，在战争中苦苦维持自己的感情；另一方面，斯罗和他所带领的、第08MS小队的队员们，也在不断的战斗中逐步培养起友谊和信赖。

主角·山本大介在年幼时因飞机失事而流落南美的亚玛逊河流，但奇迹的是他能够靠自己一个人生活下去，更在森林中练就一身钢铁般的身躯。                                                                      　　但此时邪恶组织·基度想利用古代印加文明征服世界，为了对抗基度，古代印加文明的承继兼守护者巴哥长老对山本大介施手术，并于左臂殖入印加秘宝叽叽腕轮，将他改造而成的神秘战士蜥蜴改造人·假面骑士亚玛逊。大介之后回到日本欲查明自己身世，进而展开与入侵日本的十面鬼率领之基度组织对抗的命运。

「在逐渐沉没的世界，我找到了你。」                                                                      　　在近未来，不明原因的海平面上升导致大面积地表被海水淹没。                                                                      　　幼时因意外事故失去了一条腿的少年斑鸠夏生厌倦了城市生活，迁居到了海边的乡村小镇。                                                                      　　他无亲无故，留给他的只有曾属于海洋地质学家的祖母的船和潜水艇，以及债款。                                                                      　　夏生为了取回自己“失去的未来”，潜入大海寻找据说沉睡着祖母遗产的海底仓库。                                                                      　　他在那里找到的，是沉睡在棺材状装置中的神秘少女——亚托莉。                                                                      　　她是几乎与人类无异的，精巧且感情丰富的机器人。                                                                      　　从海底被打捞上来的亚托莉说道。                                                                      　　「我想完成主人留下的最后一道命令。在那之前，我来做夏生的脚！」                                                                      　　在逐渐沉入海中的安宁小镇，少年与机器人少女难以忘怀的夏天开始了——

　　高中毕业前最后的暑假，富樫勇太（福山润 饰）和小鸟游六花（内田真礼 饰）依然过着平静的生活，只是两人的关系似乎没有更进一步的苗头。在此期间，六花的姐姐十花在意大利找到工作，遂决定举家迁往海外。而面对重度中二病患者的妹妹——连上大学都成问题的六花，作为姐姐的十花无论如何不放心将她一个人留在日本。得知要和六花分开，勇太内心充满焦灼。
　　担心二人的丹生谷（赤崎千夏 饰）想出个馊主意，于是这对少男少女展开了足迹遍布全日本的私奔之旅……