《咕噜咕噜魔法阵》讲述了一个这样的故事：在吉姆吉姆大陆上的一个小村庄吉米拉村，有一天，国王颁布了勇者召集令悬赏，如果有人能够消灭魔王将会得到五万R并且能够成为哥达国的王子。仁杰的父亲发现了召集令，为此训练他的儿子、强迫儿子成为勇者踏上旅程。吉米拉村有着旅行前不得不去拜访 魔法婆婆的规则，按照这个规则，仁杰到达了魔法婆婆的家，勇者被命令和能够使用咕噜咕噜魔法的米古米古族人歌莉一起踏上旅程。然后被国王认同是勇者的仁杰以打倒企图征服世界的魔王纪力而和歌莉开始了旅程。
拥有28万人口的三门市，其境内某天突然打开了一扇通往未知世界的大门。从大门的另一端，被称为“近界民”的怪物蜂拥而出。人类惊慌失措之余发现，地球现有的武器对近界民完全没有任何效果。危急时刻，神秘团体境界防卫组织“BORDER”出现击退近界民，三门市总算回归往昔的正常生活。如是过了四年半的时间，隐藏着作为“BORDER”成员身份的初中学生三云修（梶裕贵 配音）和转学生空闲游真（村中知 配音）相遇，而对方竟然是来自门另一头的近界民，此行的目的是为了找到自己的父亲。分出不同阵营的二人，注定要在命运的战争中激烈碰撞…… 本片根据苇原大介的同名漫画改编。
身为蒙太古（石井康嗣 配音）的儿子，罗密欧（水岛大宙 配音）一出生就拥有着显赫的家世，然而，叛逆倔强的他并不愿意走上父亲为他一手安排好的道路，为了能够体验生活了解民情，罗密欧决定“微服出巡”。在一场盛大的舞会中，罗密欧遇见了名为朱丽叶（水泽史绘 配音）的女子，朱丽叶的美丽和开朗深深地吸引了罗密欧的注意，两人之间产生了真挚的感情。 然而，罗密欧并不知道，朱丽叶出生于曾经显赫一时的凯普莱特家族，而如今，她却成为了这个惨遭灭门的家族中的唯一后代，而致使这一惨剧的不是别人，正是罗密欧的父亲。就这样，一段注定得不到祝福的恋情拉开了序幕，同时上演的，还有蒙太古与开普莱特家族曾经的恩怨情仇。
C.E.70年2月，地球联合军与ZAFT之间的武装冲突由于“染血的情人节”悲剧而全面升级为地球圈规模的战争。C.E.71年6月，在“非我即敌”的观念驱使下，地球联合军悍然发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。当战斗进行到最激烈的时候，少年真飞鸟失去了父母和妹妹。唯一的遗物就只有妹妹掉落的手机。获救之后，背负着家仇的真黯然离开了故土奥布前往PLANT。两年后，他成为了ZAFT的战士......
做事沉稳可靠，深受小弟信赖的大哥山本健太郎（小野大辅 配音）、脾气有些火爆，总是行动比头脑先行的立花亮（日野聪 配音）和对黑道生活充满了憧憬渴望能够干出一番大事业的杉原和哉（兴津和幸 配音）是黑道内的铁三角，却因为在一场意外之中做了错事而即将遭到老大犬金组长（藤原启治 配音）的惩罚。 犬金组长给了他们两个选择，一是以死谢罪，二是被送往泰国接受变性手术，然后以偶像组合的身份出道。最终，三人选择了后者，就这样，以爱理（贯井柚佳 配音）、真理（前田佳织里 配音）和千佳（赤尾光 配音）为核心成员的偶像组合后街女孩诞生了。
俺が必ず、お前を救ってみせる。 魔女教大罪司教「怠惰」担当ペテルギウス・ロマネコンティを打倒し、エミリアとの再開を果たしたナツキ・スバル。 辛い決別を乗り越え、ようやく和解した二人だったが、それは新たな波乱の幕開けだった。 想像を超える絶体絶命の危機、そして襲い来る無慈悲な現実。 少年は再び過酷な運命に立ち向かう。
