故事承接《鬼灭之刃 柱训练篇》。
1989年，日本。 乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
被卷入飞机事故的七名高中生。 他们醒来之后，发现自己身处魔法与兽人存在的异世界。 在没有电力的世界中建造核电站，仅仅是外出赚钱就能控制大都市的经济， 为了帮助为苛政所苦的恩人们而与无良贵族开战，简直为所欲为？! 不错，他们所有人都并非是普通的高中生， 而是各自立于政治、经济、科学、医疗界顶点的超人高中生！ 这是拥有地球上最高的睿智与技术的梦之队所带来的， 毫不保留地运用超高技术的异世界革命物语！
15世纪的欧洲某国。在跳级中被允许进入大学的神童拉法尔。他回应了周围的期待，宣布将专攻当时最重要的神学。但是，从以前开始就热心投入的对天文的热情一直没有被抛弃。 有一天，他遇到了一位名叫休伯特的神秘学者。因为触犯了基于异端思想的禁忌而受到拷问，被关进监狱的休伯特。 他研究的是关于宇宙的冲击性的“某个假说”——。
天医会综合医院，统括诊断部。 这里汇聚了其他医生认为“难以诊断”的患者。 甚至连警方都束手无策的“杀人案件”与“谜团”也…… 天才医生天久鹰央将揭开这些离奇“疾病”背后隐藏的惊人真相！ “这个疾病（谜题），由我来下诊断——！！”
