1989年,日本。 乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年,DIO复活了。同时,乔瑟夫的孙子,空条承太郎发现自己有幽波纹(替身)能力,DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲,陷入病危情况;为了拯救命在旦夕的母亲,承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
在少年支仓孝平(小野大辅 配音)的记忆中,自己好像一直都在转学中,这样的遭遇使得孝平很难拥有一段长久且稳定的友谊。这一次,孝平转入了修智馆学院,这所全日制的寄宿学校为孝平晦暗的心情带来了新的希望,孝平决定,一定要在这所学校里交到要好的朋友。 很快的,热情善良的孝平身边就聚集了一群朋友们。阳光健气的千堂瑛里华(神田理江 配音),娇小害羞的东仪白(峰岸由里香 配音),沉默冷静的红瀬桐叶(鸣海绘里香 配音),这些可爱女孩子们的存在丰富了孝平的课余生活,但在交往的同时,孝平也在不经意间发现了她们的秘密,这也为他进入学生会这“狼窝”奠定了基础。
故事发生于东京,在全球最大体育盛事WSG即将召开之际,知名企业的高官却接连在赞助商酒会现场遭到绑架,而自新名古屋站至东京的最高时速1000km的真空超导磁悬浮列车也被卷入其中,一场牵动国际目光的重大案件就此展开。
テレビアニメ「けものフレンズ」の新作映像の制作が決定した。