小学生静儿、大雄、强夫和胖子技安是四个最亲密的伙伴，说是亲密伙伴，是因为他们四个经常在一起玩，但强夫和胖子技安经常欺负大雄。而大雄天生就是被人欺负的对象，他胆小内向，经常被强夫和技安欺负得大哭着跑回家。不过，大雄家里住着来自未来的机器猫——哆啦A梦，哆啦A梦经常会看到大雄被欺负忍不住拿出一些未来世界的“法宝”帮助他，不过大雄大多数都会滥用这些“法宝”去作弄人，最后经常导致局面不可收拾，笑料百出……
西元2199年，来自太阳系外的敌人加米拉斯帝国，为了挽救母星的危亡，开始侵略其他星球。地球军在与加米拉斯帝国军的交战中惨败，同时加米拉斯帝国军向地球发射大量含有放射能的游星炸弹。地球的抵抗力量越来越弱。本与加米拉斯为双子星球的伊斯坎达尔星球仗义相助，向地球发送了波动引擎和波动炮的设计图纸，并告知地球军本星球拥有清除放射能的设备“宇宙清洗器D”。在与欧洲、美洲失去联系的情况下，地球防卫军利用伊斯坎达尔星球提供的技术将沉睡于海底的大和号改造为宇宙战舰。大和号全体乘员踏上了取回“宇宙清洗器D”的漫漫征程。
人类创作了许许多多的故事。 喜悦、悲伤、愤怒、感动。这些引人入胜的故事撼动着人们的心灵。 但是，那些不过是作为旁观者的感想罢了。 如果，故事中的登场人物们拥有了“意志”。那么对于他们来说，创作出故事的我们，是神一般的存在吗？ ——在我等的世界内发起变革。 ——对诸神之地进行制裁。 任何人，都将成为“创造主(Creator)”。
国中毕业之后，热爱棒球的少年泽村荣纯（逢坂良太 配音）准备放弃理想，和朋友们一起在家乡的高中完成学业，然而，此时，泽村却收到了青岛高校棒球社副社长高岛礼（内山夕实 配音）的邀请，邀请他加入棒球队。要知道，青岛高校可是棒球远动员们心目中的圣地，无数前途无量的棒球选手们出自这所学校，泽村接受了这千载难逢的机遇。 在球队里，泽村结识了一群志同道合的朋友们，心直口快大大咧咧的御幸一也（樱井孝宏 配音）、外表冷漠内心单纯的降谷晓（岛崎信长 配音）、身材矮小却实力强悍的小凑春市（花江夏树 配音）、看似腹黑却十分温柔的仓持洋一（浅沼晋太郎 配音），一行人为了完成称霸甲子园的梦想而不断挥洒着汗水，挑战着自我。
在莉莉安女子学园，有一个传统，被称为该sœur系统（sœur在法文中解作“姊妹”），其中二或三年级的学生会给予一个低年级生一串念珠，而低年级生就会成为她的妹妹，身为姊姊的高年级生须承诺会照顾妹妹，并教导他们。 当故事开始时，福泽祐巳像其他学生一样在学校入口附近的圣母玛利亚雕像祈祷之后，遇到二年级生小笠原祥子，祥子只是轻轻走近帮祐巳整理丝带。这看似简单的行为，被祐巳的朋友茑子拍下，茑子为了可以在学园祭上登出这张照片，在那天放学后强行拉祐巳到蔷薇之馆。不过祐巳在蔷薇之馆的会议室门口被正要冲出来的祥子撞个正著，祥子见到祐巳，就要求她当自己的妹妹。原来祥子被要求在学园祭上的话剧当女主角，但由于祥子十分讨厌男生，所以不愿参与演出，祥子的姊姊说：“没有妹妹的人没资格发表意见。”祥子巧遇祐巳，正好有了妹妹的理想人选。祐巳一开始认为自己没有资格担入祥子的妹妹，可是经历了几件事之后，二人终于打破障碍，成为姊妹。 后来祐巳就在山百合会帮忙，协助蔷薇大人们处理学生会的事宜，并和岛津由乃和藤堂志摩子成为好友。透过情人节和毕业典礼等活动，在圣母玛利亚的面前，大家成为好友。玛利亚的凝望的故事，就是围绕着山百合会的女孩们的小故事。
