自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。
TGS2015现场，CAPCOM宣布《怪物猎人物语》要展开动画化一消息，[1] 而现在，《怪物猎人物语》动画化又有了最新消息，负责制作本次动画的富士电视台方面意气洋洋地透露希望本次能够制作成日本国民动画. 制作方表示，《怪物猎人物语》动画定位是《海螺小姐》、《樱桃小丸子》、《海贼王》等知名的日本国民动画作品，并希望制作成富士电视台具有代表性的动画作品。
该作以神秘灾害·“世界城市同时消失”5年后为舞台，讲述了少女们被3D全息图的演剧所吸引，以站在舞台上为目标的故事。
我一直只相信我的剑。没有朋友，没有家人，也没有家可归——格斯，一个孤独的剑客，在一片被百年战争震撼的土地上作为雇佣兵四处奔波。胆量能够驾驭比他身高还长的剑，并轻松击败强大的敌人。 雇佣兵组织“鹰之团”的领导人格里菲斯盯上了他。格里菲斯有着从他美丽的外表和巨大的野心中无法想象的指挥能力，他在一次决斗中赢得了格斯，并把他带入了鹰之团，以实现自己的梦想。当他们一起经历无数次激烈的战斗时，他们的朋友因信任而结合在一起。格里菲斯和格斯之间的联系已经成为一种特殊的东西。 鹰之队最终崛起，成为米德兰王国的正规军，但这只是格里菲斯实现登顶目标的第一步。与此同时，格斯被格里菲斯的”梦想“所吸引，并开始质疑自己仅仅挥舞剑的生活。但格斯还不知道，他们无尽的梦想给他们带来的可怕命运……
冬空凩（小野友树 配音）自幼就有着比一般人强烈的灵感力，常常会遭到幽灵的附身，人生因此一直都不是很顺利，甚至因此而背负上了巨额的债务。无奈之下，冬空凩只得到处寻找容身之处，就这样来到了名为摇曳庄的温泉旅馆之中。 虽然摇曳庄的所有住客都是女性，但冬空凩最终还是在这里找到了落脚之地。天真可爱的地缚灵汤之花幽奈（岛袋美由利 配音）、每天都沉浸在妄想之中的美少女偶像宫崎千纱希（铃木绘理 配音）、对妖怪感到深恶痛绝的灵能忍者高桥李依（高桥李依 配音）、酒吞童子的后裔荒霸吐吞子（加隈亚衣 配音），和冬空凩住在同一屋檐下的是这些奇奇怪怪的美少女们。
