故事发生在一年战争期间，正和初代高达的故事平行。到地球战线赴任的年轻联邦军官斯罗·亚玛达，在一次偶然的交火中，结识了敌人、也就是吉恩军的女驾驶员爱娜·萨哈林。这一对互相抱有好意的年轻人，因为正属于敌对的两方，所以不得不互相战斗，在战争中苦苦维持自己的感情；另一方面，斯罗和他所带领的、第08MS小队的队员们，也在不断的战斗中逐步培养起友谊和信赖。
ヒーローにはなれなかった…それでも誰かを救いたい！ 非合法(イリーガル)ヒーローたちによる 等身大の成長物語！ 堀越耕平氏が10年に渡り「週刊少年ジャンプ」で連載、 世界中で爆発的な人気を誇る『僕のヒーローアカデミア』。 その “ヒロアカ”の公式スピンオフシリーズ 『ヴィジランテ 僕のヒーローアカデミア -ILLEGALS-』が、待望のアニメ化！ 脚本：古橋秀之 作画：別天荒人により「少年ジャンプ+」で連載された この作品で描かれるのは、『僕のヒーローアカデミア』の数年前の物語―！ 時代は世界総人口の約8割が超常能力を持つ超人社会。 混乱渦巻く世の中で、事故や災害、そして“個性”を悪用する 敵ヴィランから人々を守る「選ばれし」職業＜ヒーロー＞。 その一方で、「選ばれる」ことはなくとも、目の前の人を救わずにはいられない人々もいる。これは、そんな非合法イリーガルヒーロー《ヴィジランテ》の物語。
东京街头，数具男性尸体被发现，这是一场由“喰种”引发的大骚乱。大学生金木研（花江夏树 配音）原以为这一切离自己很遥远，直到一个夜里，他被自己心爱的女生袭击，原来她竟是以人肉为食的喰种。生命垂危的金木通过器官移植手术，才得以侥幸存活。而移植到金木体内的器官，来源竟然是喰种。
痊愈后，金木发现自己的身体有了某种奇怪的变化，他的一只眼睛出现喰种反应，而且他再也无法进食正常人的食物。让他感到可怕的是，他开始觉得“人类”才是满足自己食欲的对象。曾经只是一个普通人类的金木，难道从此走上狩猎人类、吞食尸体的喰种之路？
私立天堂学园顺利入学的主人公秀真子 青空ひまりと星川みつき。 憧憬着爱普莉的ひみの梦ゆめは、 要培养一万个朋友！ 可是，在那个害羞的金乔的阴影里， 可能有点难……。 这样的ひまり没想到要出道了！？ 好朋友心有余悸也说不出话来 “喜鹊”终于出来了！ 可是，不管怎么说 好像有“喜剧”……。 拥抱着Himitsu的Himitsu和Himitsu，两人的Ipri开始了！！
有 230 万人口，其中八成人口为学生的「学园都市」，是比其他地区科技更为先进，并从事「超能力开发」的特殊地区。而整座学园都市中仅有七人的等级 5 超能力者之一御坂美琴，由于她的能力与个性使然，因而被卷入了学园都市中所发生的种种事件……
结城梨斗（渡边明乃 配音）正派开朗，细心友善。一直以来，梨斗都暗恋着青梅竹马西连寺春菜（矢作纱友里 配音），可是，对于恋爱一窍不通的梨斗只是将这份强烈的感情深深的埋藏在心底。终于，梨斗再也无法压抑心中对于春菜的爱意了，再三地鼓起勇气，他决定向春菜表白。 一次偶然中，一位名叫菈菈（户松遥 配音）的女孩从天而降出现在了梨斗的面前，在阴差阳错之间，菈菈竟然成为了梨斗的告白对象，就这样，梨斗和自称是外星公主的菈菈开始了同居生活。也就是从这时开始，杀手暗影（福圆美里 配音）、菈菈的妹妹娜娜（伊藤加奈惠 配音）和梦梦（丰崎爱生 配音）等人接二连三的来到了梨斗的身边。
