为了夺取主人公等所在的宫国所持有的珍贵引擎，邻国开始了日益激烈的侵略。为了迎击敌国，宫国被迫将仪式用复座式飞行艇“Simoun”改造成了战斗用战舰。还需要未性别化的“巫女”被派遣担任驾驶员，于是，她们成为了被称为“coru”的战斗小队成员。 操纵“Simoun”的少数少女被称为了“Simoun·シヴュラ（西贝拉）”因为拥有着特殊能力，她们可以选择自己成为大人的时间。但是因为战争的爆发，她们的优秀才能不得不运用在“Simoun”的操作上，换句话说，她们被强迫保持在了“少女阶段”……
高中三年级的冬天、剩下没多久的高中生活，大家都认为会在毫无变化的情况下迎来毕业之日……但在某一天，他突然回来了，在中学时搬到遥远城镇的同学，变成不合时节的转学生再次相会，伴随着某种不确定的感情、转变开始的信号微弱的发出了声响……
讲述了少女真宫樱自从幼年时被堕魔死神带离之后，获得看见幽灵的能力。在学校里樱遇见具有死神血统的同学六道轮回，随后真宫樱和六道轮回一起引导幽灵至轮回之轮。
