名侦探柯南：瞳孔中的暗杀者

这里是，“人”“神”“魔”各种族混杂的神秘世界密斯塔尔希亚。                                                                      　　世界免于巴哈姆特复活引发的崩坏，在那之后过了10年——                                                                      　　新的“人”之王袭击“神”之神殿，攻陷“魔”之国度。                                                                      　　从濒临毁灭的状况得到复兴以及更进一步的发展，王都为“人”带来了财富。                                                                      　　作为王都复兴的食粮而沦为奴隶的“魔”，以及随着信仰心的消失而失去力量的“神”。                                                                      　　在逐渐失去均衡的世界中，“人”“神”“魔”各自的正义相互交错……

　　故事发生在遥远的未来，金城拓人（保志总一朗 配音）本是一位平凡的大学生，某日，他和女友玛琪（桑岛法子 配音）参与了一场实验，然而，实验中发生了事故，导致邪恶的外星人弗兰克复活，试验所惨遭破坏，玛琪丧命，拓人亦因此而遭到了毁容。
　　在神秘人的帮助之下，拓人捡回了一条命，并且以龙·索玛的身份重新回到了大众的视线之中，此时的他内心里只有一个念头，那就是找到弗兰克，为女友报仇。从实验室逃脱之后，弗兰克意外邂逅了名为哈迪（桑岛法子 配音）的女子，并且成为了她的保护着，与此同时，哈蒂在机缘巧合之下成为了拓人的战友，命运让深陷情仇的三人再度相遇。

私立稀星学园高尾分校初中部，那是与有着表演系的本校不同的非常普通的学校。某一天，一名放弃了梦想的少女转入这所学校时，这个故事便开始了。                                                                      　　少女的名字叫做式宫舞菜。                                                                      　　她有着超人的歌舞感，因为某件事从本校转到了高尾分校。虽然打算在这里平凡度日，舞菜却遇上了谣舞蹈部这个濒临废部的社团。原本进行舞蹈活动的这个社团为了避免被废部打算展开偶像活动——                                                                      　　舞菜与同伴们一起，再次踏上了自己一度放弃的梦想之路。

1912年，实业家涉泽荣一请到了土御门家的阴阳师平井保昌和物理学家寺田寅彦施行东京改造计划，运用灵力保护国都。魔人加藤保宪唤醒了一千年前的叛臣平将门的怨灵，企图毁灭东京。他选择了将门末裔辰宫由佳理作为灵媒。在平井以及大文豪幸田露伴的守护之下，加藤的阴谋没有得逞，但由佳理腹中却开始孕育拥有恐怖力量的新生命。平井在明治天皇驾崩之日自杀。1923年9月1日，加藤引发了关东大地震，在殊死搏斗中幸田将其打伤，最终将门怨灵没有觉醒，东京被保住了。在涉泽的努力下，东京迅速重建。1927年，日本首列地铁即将开通，而加藤放出的魔物妨害了这项工程，寺田运用西村真琴发明的日本第一台机器人解决了问题。不久后，加藤的能力完全恢复，企图再次破坏东京……

他转生成被称作拥有智慧的武器·剑，一边梦想着可以与装备者相遇，一边孤独地收集技能。有一天，他不小心踏进了会吸收魔力的枯竭森林，无法动弹之时，他遇到了作为奴隶遭受欺凌的黑猫族少女。芙兰正遭遇巨大魔兽的袭击，陷入了走投无路的境地。她拔出插在自己面前的他，并利用其力量摆脱困境，给他取名为师父，成为了正式的装备者。成为冒险者的芙兰和师父，为了磨练彼此的技能开始完成各项任务。芙兰为了达到顶点进化，师父则为了实现少女的愿望。猫耳少女和宠女剑的大冒险即将开始——