《阿优之兔智来了2》的故事延续《阿优之神奇萝卜》系列，故事讲述的是阿U和他的小伙伴们看守的那颗巨大的超级萝卜有天突然变小了，博士怀疑是巨石阵的土壤含有某种只对大萝卜有作用的特殊物质，而现在这些物质已经受到了破坏，大萝卜得不到营养开始萎缩。博士推测萝卜岛周围的岛屿上一定还有同样的土壤，可以让大萝卜恢复原状。孩子们主动要求承担这个寻找土壤的任务，为了帮助大家，博士送来一只名叫兔智的机器人，它不仅智慧超群，还拥有各种能力，在保护萝卜的过程中发挥了重要作用。但是兔菲依旧不放弃自己的梦想，他带领手下跳跳和甩耳开着飞行器一路跟随阿U他们，发誓要得到超级萝卜。
著名贴吧表情滑稽回到贴吧世界后，发现有个跟自己一样的表情替代了自己在贴吧的位置。为了夺回自己的贴吧身份和地位，滑稽联合过气网红神烦狗一起，向假滑稽势力发起了挑战。
小猫姐弟俩宏贝和宏西吃了云彩面包后就能飞起来，他们与家人、伙伴间发生了许多富有童趣和教育意义的故事。东极小镇每天都沉浸在快乐、友爱、和谐的气氛之中。
张新是一名普通插画师，某日一个神秘的ID“民间鬼术”找到了他，开始给他提供大量精彩绝伦的志怪故事。张新以这些故事为蓝本开始创作漫画故事，并且渐渐成为了国内著名的漫画家。他却始终不知道这个神秘ID的背后到底是谁，又为什么会找上他，但这些神秘的故事却渐渐流传开来。
本美术片为剪纸片。 小白猴在河边玩耍时，时常出没于水面的活蹦乱跳的鱼引起了它的兴趣，招手喊来小红猴、小黄猴和小蓝猴后，四只小猴很想搞到手几条尝尝鲜。看见打鱼女用鱼叉叉鱼一叉一个准，它们连忙找来树枝做成叉子效仿，可是没叉到半条鱼；又见老翁用钓鱼竿钓鱼钓了一条又一条，它们有了新主意，可是效果仍不大好；再见渔夫用渔网网了好多大鱼时，它们恍然大悟，然而仍是只在闹笑话。渔夫打完鱼收工回家，四只小猴尾随着来到他家，并趁他睡下时偷走了渔网，它们以为这下一定能打到好多鱼。
