这就是九龙寨城，一个东方妖窟。怀旧的人们生活的反乌托邦，过去、现在和未来在城市景观中交叉。一部理想的爱情浪漫剧，生动地描绘了三十多岁的工作男女所赋予的秘密感情和与日常生活的关系。 名为鲸井令子的地产女职员爱上了同事工藤发，却发现对方在通过自己看“他人”。同时鲸井令子也意外地窥探到九龙的另一面，究竟是真实还是虚幻，唯有深空中母星悄然无声。
故事发生在一年战争期间，正和初代高达的故事平行。到地球战线赴任的年轻联邦军官斯罗·亚玛达，在一次偶然的交火中，结识了敌人、也就是吉恩军的女驾驶员爱娜·萨哈林。这一对互相抱有好意的年轻人，因为正属于敌对的两方，所以不得不互相战斗，在战争中苦苦维持自己的感情；另一方面，斯罗和他所带领的、第08MS小队的队员们，也在不断的战斗中逐步培养起友谊和信赖。
在这个世界上，存在着能够永生不死的人类，即使遭到致命的重创，也会在短时间内迅速恢复，人们称之为“亚人”。永井圭（宫野真守 配音）是一名平凡的高中生，某日，一场车祸让他亚人的身份曝光，随即遭到了有关政府部门的高价通缉，在曾经的好友海斗（细谷佳正 配音）的帮助下，永井圭踏上了永无止境的逃亡之路。 途中，永井圭结识了同为亚人的佐藤（大冢芳忠 配音），佐藤想将永井圭纳入自己暗中组建的亚人团体之中，敏感的永井圭却发现了佐藤隐藏极深的真实面目和目的。亚人一直遭到政府的迫害和残酷研究，因此佐藤企图通过一系列恐怖袭击活动来夺回属于亚人的权利，永井圭则投靠了亚人管理委员会的户崎（樱井孝宏 配音），在他的带领下对抗强大的佐藤。在亚人和人类之间，一场充满了硝烟和鲜血的战争即将拉开序幕。
混杂于群众之中，以人类的肉为食。 拥有人类的形态，却与人类不同的存在……“喰种”。 对“喰种”进行驱逐、研究的CCG，为了达成某个命题，而新设了实验体集团。 ——其名为“Quinx”。 并非“正经人类”的他们，与佐佐木琲世一等搜查官一起 在“东京”面对的事物究竟是——！？ 描绘《东京食尸鬼√A》2年后的新章《东京食尸鬼:re》终于启动。
在一场阴谋中，高中生星村真姬娜（秋山奈奈 配音）及其全家被名为“七星”的神秘组织全数杀害。之后，和尚田神景世（藤原启治 配音）利用属大元帅系真元密宗的光言宗的神秘法术将真姬娜复活使其成为“尸姬”——一种死前怨念极深，复活后拥有异于常人的强大行动力的活死人。尸姬通常为女性，按照契约中所述，她们要跟同类“尸”战斗，当斩杀满108个敌人后，即可获得通往极乐世界的资格。 不久之后，田神景世战死，他与真姬娜的契约转换到了其养子花神旺里（羽染达也 配音）手中。在同伴的帮助下，真姬娜开始追查杀害父母的真凶的下落，而邪恶的“七星”也为了某些秘密的目的而开始蠢蠢欲动。
