正篇讲述关系很亲密的5个人组成的小组织“Little Busters”的成员——少年直枝理树和领袖人物枣恭介为了享受最后的高中生活而组建了一支棒球队“Little Busters”，然后棒球队的成员们遇到了各种各样的烦恼的故事，本作作为特典动画剧情分别由佳奈多、佐佐美、沙耶这三名女性角色，主要会围绕她们各自的故事展开。
心怀对同伴的思念，向自己所相信的道路前进！ 经历了与黑暗公会“冥府之门”的激斗，以及与养育之亲“火龙伊格尼尔”的悲哀离别， 纳兹为了变得更强而与伙伴哈比一同踏上修行之旅。 另一方面，“妖精的尾巴”会长马卡洛夫突然下达了公会解散命令，自己也隐藏了行踪。 此后约1年，露西一边做着见习记者的工作，一边收集着散落大陆各处的旧时同伴的情报。 之后，在一年一度的“大魔斗演武”进行取材的某天，结束了修行的纳兹出现在露西面前！ 宣告魔导士公会“妖精的尾巴”的复活，怀着同样的信念，纳兹、露西、哈比的寻找同伴之旅开始了！！
十二岁的神山满月（绪方惠美 配音）和外婆相依为命，酷爱唱歌的她却由于喉部的癌症而被外婆严令禁止歌唱。满月和幼年玩伴英知（木村良平 配音）有着约定，为了完成约定，满月向着成为歌手的道路上努力前进。某一日，一个名为“香葱拉面”的组合出现在了满月的满前，他们自称见习死神拓人（斋藤恭央 配音）和由依（本多知惠子 配音），他们告诉满月，她只剩下一年的寿命，而只要拿到她的灵魂，拓人即可成为正式的死神。伤心的满月感动了由依，他们决定帮助满月在死前达成她最后的心愿。 由依将满月的外表变成了十六岁的少女，这样她才够资格参加歌唱大赛。没想到，满月以“FULLMOON”的艺名一举获得成功，而在此过程中，拓人对满月的感情也渐渐变得复杂起来。英知的归来让拓人颇受打击，而拓人遗失已久的记忆也将成为威胁到拓人生死存亡的关键。
描述一位名叫小夜的少女与称为翼手的生物之间的战斗。 1966年，秋天。时值越战时期，在日本国内的美国空军横田基地内，不时可见F4幻影战斗机频繁起降，空气中充斥着一股杀戮的气氛；就在此时，基地附近的市区连续发生了离奇的命案。地下铁，银座线，正驶著通往浅草的最后一班列车，一名少女出现在空荡的车厢内，她拥有令大人感到刺眼的眼神，紧闭着双唇欲诉说她内心的真正意念，她的名字叫小夜(SAYA)；她是“组织”(名词)为了打倒潜伏于人类社会里的吸血鬼“翼手”，因而派遣至人类社会的救世主。穿着水手服的小夜，手持日本武士刀作为武器，潜入了基地内的美国学校...
