「前章」が2005年12月17日から、「後章」が翌年の2006年12月15日から先行放送され、各章とも先行放映翌年からDVDが発売された。クライマックスの黄金聖闘士12人全員集結の場面では、アイオロス役の屋良有作が19年ぶりに『聖闘士星矢』への参加となった

　　大雄相信天空上有云之国，遭到好友们的嘲笑。哆啦A梦用未来的神奇工具和大雄共同打造属于自己的云之国，建好之后，好友们被邀请上来，大家度过一段快乐的时光。
　　漂浮的云之国停在阿尔卑斯山上，大雄他们解救了一个神秘的男孩，不久后男孩失踪。正当他们四处寻找的时候，突然真正的云之国出现在他们面前。小伙伴们受到邀请，见识到了云之国高度发达的文明，深表惊奇。但是他们却被天上人软禁，无法回到地面。更进一步得知，天上人正在密谋一个“诺亚计划”，企图用洪水将为非作歹的人类从地球上抹去……

　　大雄（小原乃梨子 配音）为了拥有跟小夫（肝付兼太 配音）一样的宠物机器狗，擅自从哆啦A梦（大山信代 配音）的空间袋订了很多机器人。没想到却将另一个星球的波克（桑岛法子 配音）也牵连进来。由于波克严重受损，只有把他带回去他原来的世界，才能得救。于是大雄一行人决定护送这个孩子回去，后来他们遇到了机器人医生查贝克博士（穂积隆信 配音）。原来这个机器王国本来是人类跟机器人和平共处的世界，但是在艾德姆国王因拯救机器人，而身亡后，继位的珍娜女王（新山千春 配音）由于打击过大，于是把机器人当做奴隶并把他们变成只听从人类的忠实道具来使唤。这主要也是因为珍娜女王听信邪恶司令官铁斯塔（森山周一郎 配音）的话，下令改造机器人。铁斯塔一开始就打算利用珍娜，目的是要夺取这个国家。在大雄等人的协助下，人类与机器人在机器王国能回到过去的和平吗……

　　与假面骑士Thousand Ark的游戏中取得胜利的檀黎斗借着幻梦无双卡带的力量，陆续收购IT相关的风险投资企业，扩大幻Corporation。但随后Smart Brain的形象女郎兼社长秘Smart Queen出现，宣告已经完成了幻梦Corporation的收购。其目的是黎斗创造游戏的力量。 黎斗拿着幻梦无双卡带逃离现场，然而电池耗尽令他静止了。 而救助黎斗的是意外的人物ーーー。

　　第3季故事将讲述在神殿担任见习青衣巫女的梅茵和她的朋友路兹、姊姊多莉与孤儿院的孩子们一同制作了儿童版圣典绘本，对于书籍热情越来越高的梅茵，决定挑战下一个目标「活版印刷」。
　　梅茵强大的魔力和丰富知识也让贵族们发现了她的利用价值，以及对梅茵怀恨在心的贵族，也纷纷暗地里瞄准梅茵。为了安全起见，安排了一名护卫骑士保护梅茵，更在神官长斐迪南命令下，梅茵成为了贵族卡斯泰德的养女。
　　与此同时，梅茵的家族中也有了新生命的诞生，梅茵因而成为姊姊，加上梅茵侍从之一的戴莉雅，和遗弃在孤儿院有着身蚀的戴尔克……梅茵想守护的人事物越来越多，瞄准着她的恶魔之手也步步逼近，梅茵究竟会发生什么！？

　　于2011年底至2012年初发售的两卷OVA，是《女皇之刃》过渡至《女皇之刃 叛乱》的故事。本卷附录于《女皇之刃Premium Visual Book》中，另一卷《圣女的烦闷～信仰之门、重开》则附录《女皇之刃 叛乱 Premium Visual Book》之中。
　　本卷于2011年10月发售，画册详细信息请见上文“其它相关书籍-其它画册”。本卷动画故事发生于《女皇之刃》以及新篇《女皇之刃 叛乱》之间的时间，本卷除了熟悉的角色艾琳外，第二代叛乱的主角安妮洛特也会登场，讲述她成为美斗士前的状态。

为了拯救天界的危机，路西法重新开始行动。
在这样的情况下，曾经被打倒的罪恶天圣凯特尔以对路西法的极度憎恶为粮食复活了。
但是，那强烈的憎恶，不知不觉间变成了扭曲的爱……！
凯特尔为了与路西法结合，进入了友利等9名大天使长之一，开始了玩弄她们之间信赖关系的“凯特尔挑战”。
究竟鲁西法能否阻止凯特尔的暴走……！？

第二季讲述的剧情是人类曾一度因被巨人捕食而崩溃。幸存下来的人们。