在行星Zi上，一心希望成为象父亲那样成为优秀的zoids机师的少年邦，同欧卡诺伊多（Organoid）奇克和神秘少女菲妮一起踏上找寻zoids eve的旅途，并粉碎了帝国首相普罗因兹企图控制帝国，占领共和国的野心。
主角阿人（浪川大辅 配音）是个蓬头垢面的流浪儿，然而他体内隐藏着强大的力量。城内怪异事件频发，当阿人回到家中，发现相依为命的爷爷倒地不起。失去爷爷后的阿人和被他搭救过的阿姨生活在一起。 时过境迁，阿人长大成人，在又一次杀人魔肆虐的事件中，他重遇了昔日好友天城高雅（宫野真守 配音）和天城小叶（花泽香菜 配音）。在战斗中阿人被抓走，一个追寻他多年的神秘老人向他揭开了多年来的秘密。杀人魔其实是他们开发出来的PLAYER，失控后他们又开发了对抗杀人魔的武器——Z•E•T，即阿人。他左手上的“暴走之轮”，可以将怪物强制变回原貌，阿人是作为根除杀人魔的最后希望。阿人的“爷爷”是当年的研发人之一，他一心希望阿人可以作为普通人类生活。为了保护所爱之人，阿人下定决心要成为Z•E•T…
根据手冢治虫在漫画中的设定，阿童木的生日在2003年4月7日。所以，在2003年4月，富士电视开始播放第三度重制的电视动画《自动机器人·铁臂阿童木》(アストロボー·鉄腕アトム) 。
原作・梅田阿比原案 新作OVA
